O Mestrado em Engenharia Química tem como objetivo geral a preparação dos estudantes para uma carreira profissional em atividades práticas ou de investigação em Engenharia Química ou em áreas afins. Acentuando uma cultura prática de engenharia em simultâneo com a atividade de projeto, o ciclo de estudos oferece aos estudantes a possibilidade de adquirirem competências mais específicas numa das seguintes especializações:
i. Processos e Produto; ii. Energia; iii. Biotecnologia; ou iv. Ambiente.

A base de formação transversal do ciclo de estudos é a Engenharia Química com possibilidade de especialização num de quatro domínios, juntamente com formação nas áreas de gestão, segurança, qualidade e desenvolvimento pessoal. A prática da engenharia é acentuada através de uma perspetiva pedagógica em constante renovação, aliada a um esquema de aprendizagem virado para o projeto de engenharia alargado a áreas afins à Engenharia Química.
Assim, o percurso do estudante possui um conjunto de unidades curriculares transversais, independentes da especialização escolhida, conteúdos específicos de acordo com a especialização escolhida, e conteúdos opcionais que poderão estar ou não alinhadas com a especialização selecionada. As metodologias de ensino privilegiam uma formação mais aplicada e prática, com maior autonomia dos estudantes e predominância de práticas de avaliação contínua/distribuída.

Da perspetiva de formação, o Mestrado em Engenharia Química promove o desenvolvimento ou aquisição, ao longo do período de aprendizagem, das seguintes competências:

• Analisar e resolver, de forma científica e sistemática, problemas fundamentais e complexos em Engª. Química e áreas afins, recorrendo a métodos inovadores;
• Ter consciência e aplicar os métodos disponíveis para a conceção, projeto, implementação e operação de sistemas em contextos industriais e sociais, bem como no desenvolvimento de novos produtos, processos e metodologias;
• Planear e executar atividades de investigação, teórica ou experimental, de forma independente;
  iv. Ser capaz de trabalhar e comunicar em equipas, sejam elas multidisciplinares ou de diferentes níveis, em contexto nacional ou internacional.